Resultado Proyecto

Uso combinado de marcadores polimórficos de evolución rápida y lenta en la filogenia del cromosoma Y de pequeños rumiantes domésticos

Referencia: CGL2008-03949/BOS. Organismo financiador: Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria. Importe: 130.438 €. Duración: 2008-2011.

Equipo investigador

Luis José Royo Martín. SERIDA
Félix Mª Goyache Goñi. SERIDA
Isabel Álvarez Fernández. SERIDA
Lucía Pérez Pardal. MICINN (becaria)
F. Abel Ponce de León. Universidad de Minnesota

Equipo técnico

Iván Fernández Suárez. SERIDA
Carmen Rincón Hernández. SERIDA

Entidades Colaboradoras

Asociación de Criadores d’Oveya Xalda d’Asturies (ACOXA)
Asociación de Criadores de Cabra de Raza Bermeya (ACRIBER)

Avance de resultados

Se presentan los resultados del genotipado con los marcadores identificados en el cromosoma Y de las especies de pequeños rumiantes domésticos:

Ovino: Se han identificado dos SNPs y dos microsatélites en la región no recombinante del cromosoma Y ovino. Se han diseñado protocolos específicos para genotipar 548 machos de 68 poblaciones de ovejas domésticas y muflones de África, Asia, América y Europa (incluyendo la raza autóctona asturiana Xalda).

Caprino: Se han identificado nueve SNPs y tres microsatélites localizados en la región no recombinante del cromosoma Y caprino. Se ha diseñado protocolos específicos pare genotipar 300 machos de 30 poblaciones de cabras de África, Asia y Europa (incluyendo la raza autóctona asturiana Bermeya).

Ovino

El genotipado de 548 machos de poblaciones de ovejas domésticas y muflones originó tres haplogrupos y 28 haplotipos. Los haplogrupos son combinaciones diferentes de SNPs, y los haplotipos combinaciones de alelos de los microsatélites dentro de cada haplogrupo. En este caso los haplogrupos comparten haplotipos, lo que nos indica que o bien la división que observamos en haplotipos no tiene estructura filogenética, o que la información que proporcionan los marcadores no es suficiente para inferir la filogeografía de los ovinos domésticos.

La figura 2 recoge los 28 haplotipos diferentes encontrados en un árbol filogenético tipo "Network" (Figura 1).

Figura 1: Imagen "Network" de los 28 haplotipos identificados en el cromosoma Y de los ovinos.

Caprino

Con los genotipos obtenidos las muestras se agrupan en siete haplogrupos diferentes (Figura 2) y 17 haplotipos. Los haplogrupos no comparten haplotipos, lo que indica cierta consistencia en la división y separación de los haplogrupos, y por tanto una estructura filogenética (Figura 2).

Figura 2: Árbol filogenético UPGMA de los haplogrupos identificados en el cromosoma Y caprino. Se ha usado un macho de cabra montés de Gredos como referencia (CapYwt).

Los genotipos de los 300 machos caprinos domésticos (más uno silvestre usado como referencia), se utilizaron para construir un árbol filogenético "Network". En la Figura 3 se muestran los 17 haplotipos identificados en el cromosoma Y.

Figura 3: Imagen "Network" de los haplotipos del cromosoma Y caprino.

Se observa cierta estructuración geográfica, siendo mayoritario el haplogrupo CapY2 (derecha) en las poblaciones africanas, mediterráneas y península arábiga (negro, gris y marrón), y los haplogrupos Y1 (izquierda) en poblaciones europeas (azul y verde). La península ibérica (rojo) parece tener una posición intermedia entre ambas, apareciendo tanto haplotipos CapY2 como CapY1.