Resultado Proyecto

Genómica comparativa entre ganado bovino y ovino para identificación de la aquitectura genética de la adaptación al ambiente y parasitosis: validación en ganado frisón

Referencia: AGL16-77813-R. Organismo financiador: Ministerio de Economía y Competitividad (Programa Estatal de I+D+i Orientada a los Retos de la Sociedad). Cofinanciado por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) . Importe: 133.100 €. Duración: 2016-2019.

Equipo investigador

Felix Goyache. SERIDA
Isabel Álvarez. SERIDA
Ramón A. Juste. SERIDA

Equipo de trabajo

Iván Fernández. SERIDA
Albert Soudré. INERA
Amadou Traoré. INERA
Lucia Perez Pardal. CIBIO-Universidade do Porto
Albano Beja-Pereira. CIBIO-Universidade do Porto
Vânia Costa. CIBIO/InBio,Universidade do Porto

Avance de resultados

El objetivo del proyecto es la identificación de áreas genómicas de interés general para adaptación al medio y resistencia a enfermedades en rumiantes domésticos genómica comparativa. Se han realizado actividades de obtención y caracterización de muestras ovinas y bovinas, muestreadas en las mismas condiciones eco-ambientales, para su genotipado con Chips de SNP de media y alta densidad. Se ha realizado un trabajo de campo que ha permitido determinar los factores ambientales que influyen en la resistencia a parasitosis gastrointestinales en 464 corderos Djallonké (iniciativa I1B/4718-1) obteniéndose 271 muestras de ADN. Con medidas repetidas para cada animal, se ha valorado el número de huevos en heces de Haemonchus contortus, hematocrito y calificación FAffaMAlanCHArt®. El sexo, la edad y el peso vivo del individuo influyeron estadísticamente en los resultados. Las correlaciones entre caracteres y entre momentos de muestreo fueron congruentes con la bibliografía científica. Se ha encontrado gran variabilidad fenotípica potencialmente útil para realizar estudios de asociación genómica, resultando aconsejable usar valores genéticos aditivos en vez de registros fenotípicos para mejorar la precisión de los resultados. Las 271 muestras de ADN disponibles se han genotipado con una batería de 29 microsatélites para crear un pedigrí artificial que maximice la correlación entre las matrices de coascendencias moleculares y genealógicas de los individuos estudiados y posterior estima de valores aditivos. También se han muestreado poblaciones bovinas Kuri y Bororo de Níger, de especial importancia para el proyecto ya que se trata de Bos taurus africano tripanosusceptible y de conocida resistencia a parasitosis gastrointestinales (Kuri) y B. indicus africano con menor flujo genético con poblaciones B. taurus africano tripanotolerante. Se han caracterizado esas poblaciones para caracteres zoométricos y de tipo lo que permitió seleccionar muestras de ADN (28 Kuri y 30 Bororo) para su genotipado con Chips de SNPs de alta densidad. Asimismo, se han optimizado métodos basados en PCR para el diagnóstico de tripanosomiasis y se han aplicado en 417 muestras bovinas, 255 ovinas y 128 caprinas disponibles en el banco de ADN del SERIDA, encontrándose señales de infestación de Trypanosoma congolensis (9 bovinos) T. vivax (2) y T. brucei (en bovino y caprino). Estos análisis permitirán refinar los análisis previstos al poder contrastar la información genómica de ganado B. taurus africano sano e infectado.