Resultado Proyecto

Genómica comparativa entre ganado bovino y ovino para identificación de la aquitectura genética de la adaptación al ambiente y parasitosis: validación en ganado frisón

Referencia: AGL16-77813-R. Organismo financiador: Ministerio de Economía y Competitividad (Programa Estatal de I+D+i Orientada a los Retos de la Sociedad). Cofinanciado por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) . Importe: 133.100 €. Duración: 2016-2019.

Equipo investigador

Felix Goyache. SERIDA
Isabel Álvarez. SERIDA
Ramón A. Juste. SERIDA

Equipo de trabajo

Iván Fernández. SERIDA
Albert Soudré. INERA
Amadou Traoré. INERA
Lucia Perez Pardal. CIBIO-Universidade do Porto
Albano Beja-Pereira. CIBIO-Universidade do Porto
Vânia Costa. CIBIO/InBio,Universidade do Porto

Avance de resultados

Se han caracterizado nuevas poblaciones bovinas del África occidental contribuyendo a la documentación de recursos genéticos animales promovida por la FAO (Moussa et al., 2017). Asimismo, durante su selección para genotipado de alta densidad y secuenciación, se caracterizó la singularidad genética de las muestras bovinas obtenidas. De ello se ha derivado un mayor conocimiento, de interés multidisciplinar, del origen del ganado del oeste de África (Pérez- Pardal et al., 2018).

Se ha caracterizado por primera vez, la capacidad para resistencia de parásitos gastrointestinales de la oveja Djallonké. Se ha generado conocimiento de interés general: a) demostración de la capacidad de los modelos de estimación sin genealogías (Álvarez et al., 2018); b) identificación de áreas genómicas relacionadas con este carácter (básico en ganadería ovina) en ambientes fuera de los estándares productivos (Álvarez et al., 2019).

Se han obtenido por primera vez, los perfiles genómicos de la oveja Djallonké y se han aplicado nuevas técnicas de identificación de huellas de selección en segmentos genómicos homocigotos asegurando que no resultan de sucesos demográficos recientes sino de procesos antiguosde importancia evolutiva. Las huellas de selección identificadas sugieren que la importancia de los cromosomas BTA4 y BTA/ para la tripanotolerancia bovina pueden haberse mantenido entre especies (Álvarez et al., 2020 a,b).

Se ha aplicado la experiencia obtenida en la oveja Djallonké a perfiles genéticos de alta densidad de 10 poblaciones bovinas de África occidental clasificadas como Bos taurus (3), B. indicus (3) y sanga (4) para identificar, por primera vez, áreas genómicas con huellas de selección solapantes con segmentos genómicos homocigotos generados más de 1000 generaciones atrás propias de cada uno de esos tres tipos de ganado, esto es, libres del efecto del intenso flujo de genes entre poblaciones ganaderas de esa región continental. Se ha secuenciado el exoma de un subconjunto de 48 de esos individuos (21 B. taurus, 8 B. indicus y 13 sanga) incluyendo 12 individuos en los que se diagnosticó la presencia de Trypanosoma spp. Cinco individuos B. taurus europeos se incluyeron como referencia. Esta información única permitirá la identificación de mutaciones asociadas a regiones genómicas asociadas a selección ancestral en ganado bovino de África occidental y establecer su relación con el genoma del bovino europeo.