Resultado Proyecto

Global Omic Data Integration on Animal, Vegetal and Environment Sectors

Referencia: Horizon 2020-NMBP-TR-IND-2020 GA No. 952908. Organismo financiador: HORIZON 2020 UE. Importe: 356.093 €. Duración: 2020-2024.

Equipo investigador

Equipo investigador en el SERIDA
Enrique Gómez Piñeiro
Equipo Técnico en el SERIDA
Susana Carrocera
Aurora García
Isabel Gimeno

Avance de resultados

El área de Genética y Reproducción Animal del SERIDA participa en el proyecto GLOMICAVE a través de un consorcio formado por 14 entidades (centros de investigación, centros tecnológicos, empresas y universidades) de 6 países europeos. Se trata de desarrollar una gran plataforma digital capaz de asociar fenotipos (los caracteres observables de un individuo) con datos obtenidos mediante tecnologías analíticas de alta resolución (las llamadas ÓMICAS: Metabolómica, Genómica, Transcriptómica, Proteómica).

El SERIDA continúa aportando su experiencia en biomarcadores predictivos de la capacidad de gestación de embriones y receptoras, aplicada en esta ocasión al ganado Holstein. Así, durante 2021 se ha realizado un estudio preliminar (Starting study) proteómico y metabolómico (GC-MS) de un conjunto de muestras de plasma de receptoras de embriones, en las cuales se había identificado previamente, mediante resonancia magnética nuclear (NMR) un grupo de metabolitos capaces de predecir eficazmente (biomarcadores) la gestación y el parto. La aplicación de las nuevas técnicas de contraste validó algunos de los biomarcadores previamente identificados y apuntó el descubrimiento de otros nuevos. Otra tarea (Consistency Study) se realizó conjuntamente en los rebaños experimentales del SERIDA (Deva) y Allice (Nouzilly, Francia), analizando la estabilidad de los marcadores identificados frente a distintas condiciones ambientales y de manejo, como son la estacionalidad, las temperaturas ambientales, rectal y ruminal, la humedad ambiental, los ritmos cirdadianos y la ingesta de alimentos. Las abundantes muestras de plasma tomadas han sido remitidas a Allice para su estudio por NMR. En paralelo, y en colaboración con Asturbiotech y la Cooperativa de Agricultores de Gijón, se han producido 175 embriones congelados y vitrificados que han comenzado a ser transferidos a receptoras Holstein de ganaderías de Asturias, al objeto de contrastar los resultados en condiciones reales con los datos experimentales.

GLOMICAVE usa instrumentos de Big Data e Inteligencia Artificial para llegar a un procesamiento automatizado de información, partiendo tanto de datos ya publicados como de datos generados de modo experimental. Se estima que la plataforma que se desarrollará en el proyecto para la asociación de fenotipos y datos analíticos podrá ser manejada por personal no experimentado y podrá representar un avance significativo, en particular en la capacidad de identificación de metabolitos y de rutas metabólicas que intervienen en procesos reproductivos y de otros tipos. Además, está previsto desarrollar, mediante analizadores portátiles, un sistema simple, fiable y de bajo coste de detección de biomarcadores capaces de identificar los ciclos reproductivos en los cuales la receptora es más fértil para mejorar la eficiencia de la transferencia de embriones.